עיקרון העבודה של מכונת הכביסה קופסא כולל בעיקר ניקוי קולי וניקוי מים בלחץ גבוה וטמפרטורה גבוהה. ניקוי קולי הוא להפריד בין עפר מהקופסה על ידי הנחת תיבת המחזור במיכל מים קולי והשתמש ברטט של הגל הקולי וכוח ההשפעה שנוצר על ידי פיצוץ הקאוויטציה. עם זאת, בגלל הכוח הנמוך של גלי קולי, בדרך כלל לוקח זמן רב לנקות ביסודיות, כך שמשתמשים לעתים קרובות יותר בלחץ גבוה וטמפרטורה גבוהה לניקוי.
Wressure וניקוי מים בטמפרטורה גבוהה הוא לשאוב את המים המחוממים לצינור הריסוס במכונה במהירות גבוהה דרך משאבת מים, ולרסס אותם דרך הזרבובית המותקנת על צינור הריסוס ליצירת זרימת מים בלחץ גבוה המרוסס על תיבת המחזור. מים בלחץ גבוה וטמפרטורה גבוהה זה יכולים לשטוף את הלכלוך על תיבת המחזור מהשטח, וניתן להוסיף ממיסים ניקוי שונים במהלך תהליך הניקוי כדי לשפר טוב יותר את אפקט הניקוי.
תרחישי היישום של מכונת הכביסה כוללים לוגיסטיקה, משלוח אקספרס, אחסנה ותעשיות אחרות, ומשמשות בעיקר לניקוי וחיטוי מכולות גדולות כמו תיבות מחזור ותיבות לוגיסטיקה. מכונת הכביסה בתיבה משיגה ניקוי וחיטוי בשיטות פיזיקליות וכימיות, כולל ריסוס עמודות מים חזקים בלחץ גבוה, צחצוח והוספת חומרי חיטוי לחיטוי מקיף. בנוסף, מכבשי קופסאות מודרניים מצוידים גם בפונקציית ייבוש, שיכולה לייבש במהירות את הקופסאות לאחר ניקוי וחיטוי כדי להימנע מההשפעה של לחות שיורית על הקופסאות.